非純化的蛋白樣本和一個(gè)特定的探針可形成一個(gè)或幾個(gè)特異的蛋白復合物。確定復合物中蛋白的特征可能會(huì )困難，可以加入目的蛋白的抗體，進(jìn)行超遷移實(shí)驗，即Super-Shift EMSA?？贵w和蛋白/探針復合物中的蛋白結合，使復合物的遷移延遲，形成超遷移。

      1）一般先做一般的EMSA測定，成功后才考慮做Super-Shift EMSA實(shí)驗。

      2）不是所有的抗體都可以用于Super-Shift EMSA，只有對非變性蛋白的表面抗原決定簇起反應的抗體才能夠用于Super-Shift EMSA。

      3）抗體的濃度要高。一般10-20ul的反應液需要使用0.5-1ul原倍的抗體。

      4）為減少非特異性反應，盡量使用純化的抗體。

      5）單抗與多抗都可用于Super-Shift EMSA，但多抗可能與DNA/蛋白復合物形成大的聚集物而不進(jìn)膠。在這種情況下，雖然看不到Super-Shift的帶，但應當可以看到DAN/蛋白復合物的電泳帶明顯減少。

      （本文轉載丁香通）