從濕實(shí)驗轉行到干實(shí)驗
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發(fā)布時(shí)間：2016-11-02
現在生物信息(bioinformation)學(xué)和計算生物學(xué)的發(fā)展如火如荼，一些從事傳統實(shí)驗研究的學(xué)者對這些研究有一些隔岸觀(guān)火的感覺(jué)，也有一些敢于吃螃蟹的人從傳統的研究領(lǐng)域轉行到生物信息(bioinformation)學(xué)和計算生物學(xué)，最近《自然》雜志也對這個(gè)問(wèn)題進(jìn)行了關(guān)注，也許對于我們了解這個(gè)領(lǐng)域可提供一個(gè)不同視角。上周《自然》新聞焦點(diǎn)特別介紹了一個(gè)飽受實(shí)驗生物學(xué)困惑的碩士研究生改行從事生物信息(bioinformation)學(xué)研究，并獲得成功的真實(shí)故事。
在生物醫學(xué)研究領(lǐng)域遭受到挫折和打擊的年輕學(xué)者，也許有一種理想選擇，就是轉行從事生物信息(bioinformation)學(xué)研究。也許他們會(huì )擔心自己缺乏生物信息(bioinformation)學(xué)所需要的計算機和數學(xué)基礎，但許多事實(shí)證明，這種轉行也許可獲得意想不到的好處，干實(shí)驗實(shí)際上給從事實(shí)驗室研究的年輕學(xué)者提供了一種新的職業(yè)方向。
在2005年到2008年攻讀碩士期間，SarahHird女士特別厭煩進(jìn)實(shí)驗室。她的工作是研究紅尾花栗鼠的分類(lèi)，她對分子生物學(xué)實(shí)驗的不確定性沮喪極了。她曾經(jīng)用6周時(shí)間試圖對花栗鼠DNA的重復序列進(jìn)行擴增，以確定不同種群的遺傳學(xué)差異，但結果一無(wú)所獲。她嘗試更換試劑、換用不同pcr儀，并重新制備樣品，仍于事無(wú)補。然后，也不知道怎么回事，突然實(shí)驗又成功了。這里描述的情況大概許多從事分子生物學(xué)研究的人都曾經(jīng)不同程度地遇到過(guò)。最終，她厭倦了這種讓人發(fā)瘋的研究，沒(méi)有繼續攻讀博士學(xué)位。
Hird碩士畢業(yè)6個(gè)月后，在路易斯安那州立大學(xué)作一份兼職技術(shù)員，在這里她發(fā)現了一個(gè)好職業(yè)方向。為了讓她可以參與一項研究項目，她的實(shí)驗室PI曾經(jīng)建議她學(xué)習一門(mén)計算機編程語(yǔ)言。Hird過(guò)去從來(lái)沒(méi)有接觸過(guò)計算機編程，通過(guò)看書(shū)和網(wǎng)絡(luò )教程的幫助下，她很快就入門(mén)并開(kāi)始著(zhù)迷這一技術(shù)。她醉心于各種算法，并發(fā)現計算機程序比實(shí)驗室工作好控制多了。
Hird于是決定繼續從事科研，但她將轉移到“干”實(shí)驗研究。這類(lèi)研究通常室需要編寫(xiě)軟件和開(kāi)發(fā)模型來(lái)分析和解釋數據。獲得攻讀路易斯安那州立大學(xué)進(jìn)化生物學(xué)博士學(xué)位機會(huì )后，Hird開(kāi)發(fā)了一些程序，寫(xiě)出了博士論文。為了加強計算機編程技巧，她重修了大學(xué)計算機專(zhuān)業(yè)課程，參加了一期暑期軟件開(kāi)發(fā)培訓班。今年她已經(jīng)開(kāi)始加州大學(xué)的博士后工作，主要致力于細菌基因序列的計算分析。
Hird的成功轉行證明，一個(gè)從事實(shí)驗研究的學(xué)者，即使沒(méi)有經(jīng)過(guò)正規的計算機專(zhuān)業(yè)培養，也完全可以從事計算生物學(xué)研究。計算生物學(xué)和生物信息(bioinformation)學(xué)的學(xué)習資源非常多，如一些培訓網(wǎng)站、論壇和培訓班等。
人都有惰性，不愿意改變自己的專(zhuān)業(yè)和習慣。常言說(shuō)，人挪活，樹(shù)挪死，調整專(zhuān)業(yè)可能沒(méi)有想象的那么困難。我的一個(gè)師姐，原來(lái)是物理學(xué)背景，后來(lái)改為神經(jīng)生物學(xué)，也作的非常不錯。因為發(fā)現DNA雙螺旋結構的克里克就是從物理學(xué)轉行到生物學(xué)領(lǐng)域的。后來(lái)國際上有許多物理學(xué)家相繼轉移到分子生物學(xué)和神經(jīng)生物學(xué)領(lǐng)域，而且都取得了非常不錯的成就。如著(zhù)名的神經(jīng)生物學(xué)家蒲慕明就是一個(gè)成功的例子。
和傳統的濕實(shí)驗相比，干實(shí)驗有不少優(yōu)點(diǎn)。首先不需要特別大的經(jīng)費投入，其次是比較靈活，可以隨時(shí)開(kāi)展一個(gè)新的研究項目，而且即使你混到PI，仍可以非常容易地親自繼續開(kāi)展研究。而傳統的實(shí)驗工作，老板一般都轉到管理方面，很少有時(shí)間親自開(kāi)展研究。當然，計算生物學(xué)也有缺陷，例如一般會(huì )認為實(shí)驗沒(méi)有傳統研究那么真實(shí)。但對于一個(gè)希望在不同的領(lǐng)域研究，能在家里和實(shí)驗室靈活開(kāi)展研究，干實(shí)驗真是一個(gè)不錯的選擇。（本文轉載于丁香園）
