科學(xué)家已經(jīng)確定了可以作為慢性炎性疾病的潛在治療方法的兩種小分子靶點(diǎn)。根據PLOS計算生物學(xué)雜志發(fā)表的論文,研究人員使用他們開(kāi)發(fā)的新的藥物篩選方法分析了這兩個(gè)分子。
稱(chēng)為T(mén)23和T8的兩種分子抑制被叫作腫瘤壞死因子(TNF)的蛋白質(zhì)的功能,其參與諸如類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節炎,克羅恩病,牛皮癬,多發(fā)性硬化等疾病的炎癥過(guò)程。抑制TNF功能的藥物被認為是最有效的對抗這些疾病的方法。然而,并不是所有的患者都對這些藥物做出了反應,并且隨著(zhù)時(shí)間的推移,它們的功效可能會(huì )消失。
為了幫助發(fā)現更好的TNF抑制藥物,Georgia Melagraki和來(lái)自希臘和塞浦路斯的同事開(kāi)發(fā)了一種新的基于計算機的藥物篩選平臺。該平臺包含TNF和另一種稱(chēng)為RANKL的蛋白質(zhì)之間共同的專(zhuān)有分子性質(zhì),RANKL也參與慢性炎性疾病。
研究人員開(kāi)發(fā)了基于先進(jìn)計算工具的平臺。然后使用該平臺來(lái)實(shí)際篩選近15,000個(gè)具有未知活性的小分子,并預測它們與TNF和RANKL蛋白的相互作用; 具體來(lái)說(shuō),就是小分子可能如何破壞導致這些關(guān)鍵蛋白質(zhì)的三聚和活化的蛋白質(zhì)相互作用(PPI)。 “這個(gè)虛擬實(shí)驗從成千上萬(wàn)的候選者中發(fā)現了九種有希望的分子,”研究共同作者NovaMechanics有限公司的Antreas Afantitis說(shuō)道。
為了進(jìn)一步評估其潛力,科學(xué)家們研究了9個(gè)小分子與實(shí)際實(shí)驗中的TNF和RANKL的相互作用。在9個(gè)分子中,T23和T8表現為特別強的TNF抑制作用。兩個(gè)分子都與TNF和RANKL結合,阻止它們與其他蛋白質(zhì)正確發(fā)生相互作用。兩者在人體中也可能引起毒副作用。
亞歷山大·弗萊明(Alexander Fleming)生物醫學(xué)科學(xué)研究中心的研究人員,即研究共同作者George Kollias說(shuō):“T23和T8可以進(jìn)一步優(yōu)化,以開(kāi)發(fā)一系列炎癥,自身免疫和骨丟失疾病的治療方法”。同時(shí),新的虛擬藥物篩選方法可以發(fā)現其他有希望的TNF抑制劑,并且可以進(jìn)行修改以尋找治療其他疾病的潛在方法。(生物谷Bioon.com)