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魚(yú)類(lèi)復雜性狀快速適應性進(jìn)化遺傳機制研究獲進(jìn)展

  中國科學(xué)院海洋研究所研究員劉進(jìn)賢課題組在Molecular Biology and Evolution上,在線(xiàn)發(fā)表關(guān)于魚(yú)類(lèi)快速適應淡水生境的遺傳學(xué)機制研究成果。該研究從基因組水平揭示魚(yú)類(lèi)快速適應淡水生境的遺傳學(xué)基礎,為生物復雜性狀快速適應性進(jìn)化的分子機制提供新認知,并對預測生物應對環(huán)境變化的適應性進(jìn)化策略具有理論價(jià)值。

  環(huán)境變化背景下生物的適應性進(jìn)化是生物多樣性產(chǎn)生的重要機制。盡管生物表型為應對環(huán)境改變可以發(fā)生快速適應性進(jìn)化,但是對于復雜性狀快速適應的遺傳機制的理解目前仍較為匱乏。部分海洋魚(yú)類(lèi)在演化的過(guò)程中進(jìn)入淡水生境,形成淡水定居型的種群,為解析復雜表型適應性進(jìn)化的遺傳機制提供契機。

  該研究以刀鱭的洄游種群及其淡水定居種群為研究對象,采用群體基因組學(xué)的研究方法,通過(guò)比較長(cháng)江水系不同的淡水定居型種群與長(cháng)江口的洄游型種群之間的基因組差異,探討海洋魚(yú)類(lèi)淡水定居種群的淡水適應這一復雜性狀的遺傳學(xué)機制。研究發(fā)現,刀鱭種群在染色體LG6和LG22上存在兩個(gè)較大的染色體倒置,這兩個(gè)染色體倒置在淡水定居種群中具有較高的頻率,但是在洄游種群中的頻率較低或未檢測到,兩處染色體倒置區域上SNP的等位基因頻率在淡水定居種群和洄游種群間也存在明顯差異;功能分析顯示,兩個(gè)染色體倒置區域富集了與代謝過(guò)程、免疫調控、生長(cháng)發(fā)育和滲透壓調節等多個(gè)生物過(guò)程相關(guān)的基因,暗示兩個(gè)染色體倒置區域上的遺傳差異可能與刀鱭洄游種群和淡水定居種群間在適應性進(jìn)化過(guò)程中形態(tài)、生理和行為等表型上的分化有關(guān),提示基因組結構變異在刀鱭淡水定居種群的淡水適應的平行演化過(guò)程中起到重要作用。

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