1.shRNA序列設計與合成
(1)客戶(hù)提供干擾序列;
(2)針對目的基因中洪代為設計并合成三對特異性的siRNA序列,根據siRNA序列設計對應莖環(huán)結構的shRNA序列,然后合成三對shRNA序列(結果中保證其中一條干擾效率不低于70%)。
2.shRNA慢病毒載體構建
將三個(gè)shRNA分別克隆入慢病毒載體,構建shRNA干擾慢病毒載體,并進(jìn)行測序鑒定構建成功。
二、目的基因干擾慢病毒載體的包裝和濃縮
1.慢病毒載體的大量包裝
大量擴增效率三組shRNA慢病毒載體和慢病毒的輔助質(zhì)粒,將三個(gè)質(zhì)粒按一定比例大量轉染293T細胞,進(jìn)行慢病毒顆粒的大量包裝。
2. 慢病毒的濃縮
包裝48小時(shí)后收集病毒,并對病毒進(jìn)行體外大比例濃縮,得到有效滴度為10^8PFU/ml的慢病毒顆粒