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【動(dòng)物實(shí)驗外包服務(wù)】-豬圓環(huán)病毒2型感染人源細胞的轉錄組分析

  目的    圓環(huán)病毒 2 型(porcine circovirus type 2,PCV2)能否感染人類(lèi)細胞一直都是一個(gè)爭論的話(huà)題。 本研究通過(guò)轉錄組測序(RNA sequencing,RNA-seq)技術(shù)分析 PCV2 感染人源細胞后的差異表達基因及其相關(guān)的信 號通路、生物學(xué)功能,以期為人源細胞對 PCV2 及其他病毒產(chǎn)生抗病毒效應的研究提供參考。

  方法    用 PCV2 感染 HeLa 細胞,然后進(jìn)行 RNA-seq 技術(shù)分析,篩選與抗病毒反應相關(guān)的差異表達基因( differentially expressed genes, DEGs),并通過(guò)實(shí)時(shí)定量 PCR 進(jìn)一步驗證。

  結果    在感染 PCV2 的 HeLa 細胞中共注釋到 15402 個(gè) UniGenes,其中有 387 個(gè) DEGs(包括 267 個(gè)上調基因和 120 個(gè)下調基因)。 對生物過(guò)程類(lèi) DEGs 進(jìn)行 GO 富集和 KEGG 通路分析, 發(fā)現富集基因要參與應激反應(97 / 291 DEGs) 和免疫系統過(guò)程(80 / 291 DEGs),其中最顯著(zhù)兩條途徑的基因是 NOD 樣受體信號途徑(21 / 170 DEGs)和單純皰疹病毒感染途徑(22 / 170 DEGs)相關(guān)差異表達基因。

  結論    PCV2 感染 HeLa 細胞之后,改變了細胞的表達譜,獲得的 DEGs 及其功能注釋信息有助于理解其抗病毒機制,對于了解 PCV2 感染人源細胞所產(chǎn)生的免疫反應及抗病毒效力提供依據。

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