目的：研究常見(jiàn)SPF級小鼠和大鼠的腸道菌群多樣性?

　　方法：分別采集廣東地區三家實(shí)驗動(dòng)物生 產(chǎn)單位的C57BL/6?ICR?BALB/c小鼠和Wistar?SD大鼠的盲腸內容物樣品,用細菌16SrDNA通用引物擴增V4-V5 區域,采用IlluminaMiseq2×300bp測序平臺進(jìn)行測序,使用生物信息學(xué)方法進(jìn)行微生物群落分析?Alpha多樣性 分析與Beta多樣性分析?

　　結果：對序列去雜優(yōu)化后OTU聚類(lèi)分析,稀釋性曲線(xiàn)說(shuō)明本次測序的數據量合理;實(shí)驗 小鼠和大鼠腸道菌群共分成八個(gè)門(mén),其中擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)?厚壁菌門(mén)(Firmicutes)占據主要地位,屬水平上 主要是擬桿菌屬(Bacteroides)?Hungatella?副桿狀菌屬(Parabacteroides)?乳酸桿菌屬(Lactobacillus)等;樣品間差異 性分析顯示相同設施來(lái)源動(dòng)物的菌群組成相似性較高;Alpha分析結果顯示來(lái)源于同種設施的動(dòng)物物種豐富度相 近;Beta分析顯示相同設施動(dòng)物的腸道菌群差異較小,但品系對腸道菌群差異性有所影響?

　　結論：不同來(lái)源設施 的飼養環(huán)境是動(dòng)物腸道菌群多樣性的主要影響因素,不同品系對腸道菌群多樣性有一定影響?