目的:對西藏小型豬全基因組范圍內的組蛋白修飾位點(diǎn)進(jìn)行注釋,并比較不同組織間組蛋白修飾的差異?

　　方法:取三月齡的雄性非同胎西藏小型豬兩只,分別取其血液?肝?小腸(回腸段)和背最長(cháng)肌的組織樣 本,進(jìn)行染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗,捕獲DNA片段進(jìn)行高通量測序? 下機數據經(jīng)過(guò)濾后比對到參考基因組上,并使 用MACS軟件統計reads在基因組上的富集情況?

　　結果:不同組蛋白在基因啟動(dòng)子區域分布的偏好位置不同,分 布規律大致分為兩類(lèi),一類(lèi)如H3K4me3組蛋白修飾主要分布在轉錄起始位點(diǎn)附近的兩側,并在距離TSS較近的下 游位置出現一個(gè)寬度較窄的明顯的峰值,另一類(lèi)如H3K9me3組蛋白修飾在整個(gè)啟動(dòng)子區域內分布較為平均,整體 呈現出中間低兩邊高的寬峰形狀;組織特異性組蛋白修飾影響的基因存在差異,對應的功能通路比較廣泛,但都參 與了RNA聚合酶II啟動(dòng)子的轉錄調控?

　　結論:本研究提供了西藏小型豬四種組織的組蛋白修飾注釋數據,為今 后以西藏小型豬為生物醫學(xué)模型的轉錄調控研究提供了基礎數據?