巢式PCR是一種變異的聚合酶鏈反應（PCR），使用兩對（而非一對）PCR引物擴增完整的片段。第一對PCR引物擴增片段和普通PCR相似。第二對引物稱(chēng)為巢式引物（因為他們在第一次PCR擴增片段的內部）結合在第一次PCR產(chǎn)物內部，使得第二次PCR擴增片段短于第一次擴增。

        實(shí)驗方法原理：由于巢式PCR反應有兩次PCR擴增，從而降低了擴增多個(gè)靶位點(diǎn)的可能性（因為與兩套引物都互補的引物很少）增加了檢測的敏感性；又有兩對PCR引物與檢測模板的配對，增加了檢測的可靠性。 由于第二套引物位于第一輪PCR產(chǎn)物內部，而非目的片斷包含兩套引物結合位點(diǎn)的可能性極小，因此第二套引物不可能擴增非目的片斷。這種巢式PCR擴增確保第二輪PCR產(chǎn)物幾乎或者完全沒(méi)有引物配對特異性不強造成的非特異性擴增的污染。

巢式PCR反應模式圖

        （本文轉載丁香通）