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熒光定量PCR實(shí)驗步驟和專(zhuān)業(yè)術(shù)語(yǔ)


      一、主要實(shí)驗步驟如下: 


      1、設計并合成 Realtime PCR 引物。 


      2. 引物溶解后使用 Promega 的 TaqDNA 聚合酶進(jìn)行含 SG(SYBR?; Green)的 PCR 反應的優(yōu)化。 


      3. 客戶(hù)樣品 RNA 抽提 。


      a.實(shí)驗對象為組織樣品,取適量(50-100 mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品加 1 ml 的 RNA 抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提 RNA。 


      b.實(shí)驗對象為細胞樣品,每份樣品取 1×106~1×107 細胞,PBS 清洗細胞,去 PBS 加 1 ml 的 RNA 抽提試劑 Trizol(Invitrogen),裂解后抽提 RNA 。


      4. RNA 質(zhì)量檢測  


      a. 紫外吸收測定法測定 RNA 在分光光度計 260 nm 和 280 nm 處的吸收值,以計算其濃度并評估 RN A純度 。


      b. 使用甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度及完整性。 


      5. 使用逆轉錄酶(Promega)進(jìn)行反應,將樣品RNA逆轉錄為cDNA。 


      6. 制備標準曲線(xiàn)樣品: 

      進(jìn)行相對定量,需要先將樣品的目的基因以及管家基因進(jìn)行PCR擴增,其產(chǎn)物進(jìn)行梯度稀釋用于做標準曲線(xiàn)。 


      7. 標準曲線(xiàn)樣品和待測樣品分別加入到含SG的RealTime PCR反應液中,進(jìn)行RealTime PCR擴增和檢測。 


      8. 檢測結果進(jìn)行標準曲線(xiàn)分析:以對待測樣品的目的基因進(jìn)行定量。相對定量實(shí)驗需要進(jìn)一步用樣品的目的基因測得值除以管家基因測得值以校正誤差,所得結果代表某樣品的目的基因相對含量。 


      9. 提供實(shí)驗報告:包括詳細的實(shí)驗方法及實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 實(shí)驗結果的相關(guān)圖表 。



      二、熒光定量 PCR 中的一些術(shù)語(yǔ)


      CT值:熒光信號有統計意義顯著(zhù)增長(cháng)(即穿過(guò)閾值線(xiàn))時(shí)的循環(huán)次數,或者說(shuō)是從基線(xiàn)到指數增長(cháng)的拐點(diǎn)所對應的循環(huán)次數。


      閾值:閾值的默認設置是 3-15 個(gè)循環(huán)的熒光信號的標準偏差的 10 倍。

      CT值與起始模板的量成線(xiàn)性關(guān)系。

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