純化是注定辛苦的旅行
路上少不了篩選和優(yōu)化
但那又怎樣
哪怕運行千遍
也要純得漂亮
我是中洪博元蛋白組,我為自己代言!
以蛋白質(zhì)和結構與功能為基礎,從分子水平上認識生命現象,已經(jīng)成為現代生物學(xué)發(fā)展的主要方向,研究蛋白質(zhì),首先要得到高度純化并具有生物活性的目的物質(zhì)。
一. 實(shí)驗試劑及材料
實(shí)驗材料:大腸桿菌BL21
試劑、試劑盒:LB液體培養基、 氨芐青霉素、 Washing Buffer Elution Buffer IPTG 、蒸餾水 、胰蛋白胨 、酵母粉、 氯化鈉
儀器、耗材:搖床 、離心機、 層析柱、 離心管、 移液槍、 槍頭盒 、燒杯 、玻璃棒
(實(shí)拍圖,請勿盜用)
二. 獲得目的基因
1.通過(guò)PCR方法:以含目的基因的克隆質(zhì)粒為模板,按基因序列設計一對引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點(diǎn)),PCR循環(huán)獲得所需基因片段。
2.通過(guò)RT-PCR方法:用TRIzol法從細胞或組織中提取總RNA,以mRNA為模板,逆轉錄形成cDNA第一鏈,以逆轉錄產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR循環(huán)獲得產(chǎn)物。
三. 構建重組表達載體
1.載體酶切:將表達質(zhì)粒用限制性?xún)惹忻福ㄍ锏拿盖形稽c(diǎn))進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。
2.PCR產(chǎn)物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。
四. 獲得含重組表達質(zhì)粒的表達菌種
1.將連接產(chǎn)物轉化大腸桿菌DH5α,根據重組載體的標志(抗Amp或藍白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質(zhì)粒,雙酶切初步鑒定。
2.測序驗證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進(jìn)入下步操作。否則應篩選更多克隆,重復亞克隆或亞克隆至不同酶切位點(diǎn)。
3.以此重組質(zhì)粒DNA轉化表達宿主菌的感受態(tài)細胞。
五. 氯霉素?;D移酶重組蛋白的誘導
1.接種含有重組氯霉素?;D移酶蛋白的大腸桿菌BL21菌株于5 mL LB液體培養基中(含100 ug/mL 氨芐青霉素),37℃震蕩培養過(guò)夜。
2.按1∶50或1:100的比例稀釋過(guò)夜菌,一般轉接1 mL過(guò)夜培養物于100 mL(含100 ug/mL 氨芐青霉素)LB液體培養基中,37℃震蕩培養至OD600 = 0.6 - 0.8(最好0.6,大約需3 h)。取10 ul 樣品用于SDS-PAGE 分析。
3.對照組不加誘導劑,實(shí)驗組加入IPTG至終濃度0.5 mmol/l,37℃繼續培養1-3h。
4.12 000 rpm 離心10 min,棄上清,菌體沉淀保存于-20℃或-70℃冰箱中。
六. 氯霉素?;D移酶重組蛋白的分離、純化
1.NTA層析柱的準備:在層析柱中加入1 mL NTA介質(zhì),并分別用8 mL 去離子水,8 mL上樣緩沖液洗滌。
2.重組蛋白的變性裂解:在冰浴中凍融菌體沉淀,加入5 mL上樣緩沖液, 用吸管抽吸重懸,超聲波破裂菌體,用振蕩器等輕柔的混勻樣品60 min,4℃ 12000 rpm 離心 30 min,將上清吸至一個(gè)干凈的容器中,并棄沉淀。取10 ul 上清樣品用于SDS-PAGE 分析。
3.上清樣品以10-15 mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流出液,取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
4.洗脫雜蛋白:用Washing Buffer以10-15 mL/h流速洗柱,直至OD280 = 0.01分步收集洗脫液,約3-4 h,取10 ul洗脫開(kāi)始時(shí)的樣品用于SDS-PAGE 分析。
5.洗脫目標蛋白:用Elution Buffer洗柱,收集每1 mL 級分,分別取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
七. 注意事項
1.選擇表達載體時(shí),要根據所表達蛋白的最終應用考慮。如為方便純化,可選擇融合表達;如為獲得天然蛋白,可選擇非融合表達。
2.融合表達時(shí)在選擇外源DNA同載體分子連接反應時(shí),對轉錄和轉譯過(guò)程中密碼結構的閱讀不能發(fā)生干擾。
3. 菌液OD值要小于1,否則細胞太濃太老,不易破碎,且質(zhì)粒易丟失。
4. 誘導時(shí)間最好做一個(gè)梯度,不同蛋白誘導時(shí)間需摸索。
5. 誘導溫度適當摸索:25、30℃。
6. IPTG濃度:一般在1 mM 以?xún)?,可適當摸索。
7. 超聲條件可視實(shí)際情況改變,只要使菌體裂解充分即可,即菌液清亮不粘稠。