實(shí)驗方法原理
采用粘末端連接必須對目的DNA分子和載體分子進(jìn)行酶切以獲得相應的粘末端進(jìn)行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡(jiǎn)單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應溫度不同,這時(shí)可以采用如下措施解決:1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切;2)先進(jìn)行低鹽要求的酶酶切,然后添加鹽離子濃度到高鹽的酶反應要求,加入第二種酶進(jìn)行酶切;3)使用通用緩沖液進(jìn)行雙酶切。具體要根據酶的反應要求進(jìn)行,盡量避免星號活力。
實(shí)驗材料 質(zhì)粒DNA
試劑、試劑盒 限制性核酸內切酶蒸餾水
儀器、耗材 微量移液槍離心機電泳儀水浴鍋紫外透射觀(guān)測儀離心管記號筆
實(shí)驗步驟
一、實(shí)驗材料準備
1. 材料:質(zhì)粒DNA。
2. 試劑:限制性?xún)惹忻?、ddH2O。
3 . 儀器:微量移液槍?zhuān)x心機,水浴鍋, 電泳儀,紫外透射觀(guān)測儀。
二、單酶切
1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:
(1)質(zhì)粒DNA:X μL(約1 μg)。
(2)限制性?xún)惹忻福? μL(約10 U)。
(3)10×buffer:2 μL。
(4)ddH2O:補足20 μL。
2. 混勻,做好標記。
3. 37℃水浴1-3 h。
4. 70℃水浴10 min中止反應。
5. 電泳檢測酶切效果。
三、雙酶切
1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:
(1)質(zhì)粒DNA:X μL(約1 μg)。
(2)限制性?xún)惹忻?:1 μL(約10 U)。
(3)限制性?xún)惹忻?:1 μL(約10 U)
(3)10×buffer:1或2 μL。
(4)ddH2O:補足20 μL。
2. 混勻,做好標記。
3. 37℃水浴1-3 h。
4. 70℃水浴10 min中止反應。
5. 電泳檢測酶切效果。
四、結果與分析
假若一種酶在環(huán)狀質(zhì)粒DNA中只有一個(gè)酶切位點(diǎn), 且酶切徹底,紫外燈下檢測電泳結果,則單酶切應為一條帶, 而雙酶切則為兩條帶。如果條帶數目多于理論值,那么有可能是酶切不完全。如果酶切結果與酶切前的質(zhì)粒條帶一樣(超螺旋、線(xiàn)性和開(kāi)環(huán)三條帶),則說(shuō)明質(zhì)粒完全沒(méi)有被切開(kāi)。
注意事項
1. 酶切的選擇原則一般是盡量擴大酶切體系,這樣抑制因素得以稀釋?zhuān)换蚪MDNA或質(zhì)粒DNA酶的用量較一般DNA大,一般為1μg/10U;所加酶的體積不能超過(guò)酶切總體積的1/10,否則甘油濃度會(huì )超過(guò)5%,會(huì )產(chǎn)生星號活力;對難切的質(zhì)?;蚧蚪MDNA應延長(cháng)反應時(shí)間4―5hr, 甚至過(guò)夜。滅活限制性?xún)惹忻富钚钥梢圆捎眉訜釡缁?,乙醇沉淀,?氯仿抽提,添加EDTA或SDS等方法,具體每一種酶可能有些方法不能完全滅活,這一點(diǎn)需要注意。
2. 雙酶切體系緩沖液添加量要根據兩種限制性?xún)惹忻缸罴丫彌_體系,可以登錄限制性?xún)惹忻纲徺I(mǎi)公司官方查看。(轉帖)
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