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質(zhì)粒圖譜之火眼金睛是如何煉成的?

質(zhì)粒和載體傻傻分不清楚


質(zhì)粒(Plasmid)是附加到細胞中的非細胞的染色體或核區DNA原有的能夠自主復制的較小的DNA分子(即細胞附殖粒、又胞附殖粒)。大部分的質(zhì)粒雖然都是環(huán)狀構型。


載體即要把一個(gè)有用的基因(目的基因——研究或應用基因)通過(guò)基因工程手段送到生物細胞(受體細胞),需要運載工具(交通工具)攜帶外源基因進(jìn)入受體細胞,這種運載工具就叫做載體(vector)。細菌或病毒質(zhì)粒是重組DNA技術(shù)中常用的載體。


簡(jiǎn)而言之,質(zhì)??梢哉f(shuō)是一個(gè)統稱(chēng),載體是質(zhì)粒改造過(guò)用來(lái)運載的工具





選用質(zhì)粒做載體的要求


以最常用的為例


(1)選分子量小的質(zhì)粒,即小載體(1-1.5kb)→不易損壞,在細菌里面拷貝數也多(也有大載體);


(2)一般使用松弛型質(zhì)粒在細菌里擴增不受約束,一般 10 個(gè)以上的拷貝,而嚴謹型質(zhì)粒<10 個(gè)。


(3)必需具備一個(gè)以上的酶切位點(diǎn),有選擇的余地;


(4)必需有易檢測的標記,多是抗生素的抗性基因,不特指多位 Ampr。


無(wú)論選用哪種載體,首先都要獲得載體分子,然后采用適當的限制酶將載體 DNA 進(jìn)行切割,獲得分子,以便于與目的基因片段進(jìn)行連接。

如何一眼看穿質(zhì)粒圖譜



①  復制起始位點(diǎn)Ori,了解質(zhì)粒的類(lèi)型(原核/真核/穿梭質(zhì)粒),Ori的箭頭指復制方向,其他元件標注的箭頭多指轉錄方向(正向)。


②  再看篩選標記,如抗性,決定使用什么篩選標記:


Ampr:水解β-內酰胺環(huán),解除氨芐的毒性。


tetr :可以阻止四環(huán)素進(jìn)入細胞。


camr:生成氯霉素羥乙?;苌?,使之失去毒性。


neor(kanr):氨基糖苷磷酸轉移酶,使G418(卡那霉素衍生物)失活。


hygr:使潮霉素β失活。


③  看多克隆位點(diǎn)(MCS):它具有多個(gè)限制內切酶的單一切點(diǎn)(質(zhì)粒上只能有該內切酶的唯一酶切序列,不然就一刀好幾段了),便于咱們要研究的基因的插入。如果在這些位點(diǎn)外有外源基因的插入,會(huì )導致某種標志基因的失活,而便于篩選,最常見(jiàn)的是β-半乳糖苷酶的藍白斑篩選系統。


④再看外源DNA插入片段大?。?/span>質(zhì)粒一般只能容納小于10Kb的外源DNA片段。一般來(lái)說(shuō),外源DNA片段越長(cháng),越難插入,越不穩定,轉化效率越低。


⑤ 是否含有表達系統元件,即啟動(dòng)子(promoter)-核糖體結合位點(diǎn)(RBS)-轉錄終止信號(AATAAA同時(shí)是poly A)。這是用來(lái)區別克隆載體與表達載體??寺≥d體中加入一些與表達調控有關(guān)的元件即成為表達載體。選用那種載體,還是要以實(shí)驗目的為準繩。


⑥看報告基因:主要是為了能迅速檢查功能基因是否表達的陽(yáng)性判斷,表達成功的蛋白在小鼠體內分布位置。

 

⑦看質(zhì)粒圖譜上的箭頭:它代表DNA兩條鏈(正義鏈和反義鏈),即質(zhì)粒是環(huán)狀雙鏈DNA,它的啟動(dòng)子等在其中一條鏈上,而它的抗性基因在另一條鏈上。目的基因片段進(jìn)行連接。

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