科學(xué)家已經(jīng)確定了數以千計的之前被忽視的(盡管罕見(jiàn))可能有助于癌癥生長(cháng)的遺傳突變。這些在PLOS計算生物學(xué)雜志上發(fā)表的研究結果可以幫助為研發(fā)新藥鋪路。
當細胞中的遺傳突變導致腫瘤的異常生長(cháng)時(shí),出現癌癥。一些癌癥藥物通過(guò)靶向針對一般形式的突變蛋白質(zhì)(因為編碼它們的基因發(fā)生突變)來(lái)攻擊腫瘤細胞。然而,目前僅已確定了一小部分對癌癥有顯著(zhù)促進(jìn)作用的突變。
馬里蘭大學(xué)的托馬斯·彼得森及其同事開(kāi)發(fā)了一種新的統計分析方法,其使用癌癥患者的遺傳數據來(lái)發(fā)現致癌突變。與以前關(guān)注個(gè)別基因突變的研究不同,新方法解決了相關(guān)蛋白家族共享的類(lèi)似突變。
具體來(lái)說(shuō),新方法重點(diǎn)集中在被稱(chēng)為蛋白質(zhì)結構域的蛋白質(zhì)的亞組分中的突變上。即使不同的基因編碼它們,不同的蛋白質(zhì)可以共享共同的蛋白質(zhì)結構域。該新策略利用蛋白質(zhì)結構域和功能的現有知識來(lái)確定蛋白質(zhì)結構域內位置更突出的腫瘤。
使用這種新方法,研究人員確定了數千種罕見(jiàn)的腫瘤突變發(fā)生在與其他腫瘤的其他蛋白質(zhì)中發(fā)現的突變相同的結構域位置——暗示著(zhù)它們可能參與癌癥的發(fā)生。
Maricel Kann研究的資深作者說(shuō):“也許只有兩名患者在特定蛋白質(zhì)中有突變,但是當你意識到這一區域與癌癥患者其他蛋白質(zhì)的突變位置完全相同時(shí),你就意識到重要的是研究這兩個(gè)突變。
研究人員已經(jīng)提出術(shù)語(yǔ)“oncodomain”是指更可能含有致癌突變的蛋白質(zhì)結構域。 Oncodomains的進(jìn)一步研究可以幫助藥物開(kāi)發(fā):“因為這么多蛋白質(zhì)的結構域是相同的,”Kann說(shuō),“單次治療可能會(huì )解決廣泛的突變型蛋白質(zhì)引起的癌癥。”(轉載自生物谷)