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最新臨床標本檢測結果指出:甲基化試驗有助于區分原發(fā)腫瘤類(lèi)型

   

    去年的一項最新發(fā)明,表觀(guān)遺傳學(xué)測試EPICUP?,讓醫生有能力區分已經(jīng)發(fā)生轉移的未知性癌癥(Cancer of Unknown Primary,CUP)患者屬于哪種原發(fā)腫瘤類(lèi)型。76日《Nature Reviews Clinical Oncology》(《自然評論:臨床腫瘤學(xué)》,影響因子20.69)發(fā)表了這項發(fā)明的相關(guān)優(yōu)勢和轉移到臨床實(shí)踐的最新進(jìn)展。                  

              

 

未知性癌癥(CUP)在轉移性腫瘤患者中占比10%,然而這些癌癥的原發(fā)腫瘤位置通常無(wú)法確定。由于無(wú)法分辨究竟是哪種腫瘤類(lèi)型,這些患者的生存率很低。

 

“傳統方法只能鑒定30%不明病灶的轉移性腫瘤的原發(fā)腫瘤位置,一些分子生物學(xué)方法可以提高這一比例,但往往造價(jià)昂貴,并且,所使用的RNA樣本比較脆弱容易在醫院進(jìn)行解剖操作時(shí)被損壞,”文章作者、Bellvitge生物醫學(xué)研究所(IDIBELL)表觀(guān)遺傳學(xué)與腫瘤生物學(xué)項目協(xié)調人Manel Esteller博士解釋道。

 

EPICUP?檢測則是基于更穩定的DNA分子,允許醫務(wù)人員以更簡(jiǎn)單的方式進(jìn)行采集、保存和運輸。一周之內即可出具檢測報告?!?/span>

 

革命性的EPICUP?檢測將使CUP的檢測和治療更加有效。正如文中總結:“正確的、更特異性的、低侵襲性診斷試驗可使CUP患者從中受益?!?/span>

 

表觀(guān)遺傳學(xué)機制通常被理解為“在不改變DNA序列的條件下的基因表達水平調控機制”。盡管染色質(zhì)重塑、非編碼RNAs、DNA-蛋白質(zhì)相互作用、轉座因子流動(dòng)性抑制、細胞分化、X染色體失活和基因印記等因素也能調控基因表達,但是哺乳動(dòng)物細胞中的胞嘧啶碳五的甲基化共價(jià)修飾仍起主導表觀(guān)遺傳學(xué)作用。

 

可遺傳的、在發(fā)育過(guò)程中具有持續表現力的表觀(guān)遺傳標簽變化已被證明是同一基因型下生成多種表型的重要原因。在不恰當的時(shí)間地點(diǎn)添加錯誤類(lèi)型的表觀(guān)遺傳學(xué)標記與許多疾?。òò┌Y)的發(fā)生息息相關(guān)。更重要的是,DNA甲基化抑制許多抑癌基因表達,如CDKN2A,CDKN2B,MLH1,MGMTCDH1等,從而影響癌癥進(jìn)程。

 

具有相同組織病理學(xué)和遺傳特征的腫瘤可能表現出完全不同的表型。舉一個(gè)明顯的例子,同樣是BRAFV600E 突變型黑色素瘤,雖然低甲基化賦予了機體對BRAFMEK抑制劑的更大敏感性,但是TBC1D16-47KD轉錄本的表觀(guān)遺傳學(xué)再活化將導致更差(高出4倍風(fēng)險)預后。

 

因此,揭示腫瘤特異性指紋甲基化CpG島的DNA甲基化譜不僅能識別腫瘤類(lèi)型,還可預測患者預后和抗腫瘤治療反應。

 

科學(xué)家們使用高通量方法,首次探訪(fǎng)了超過(guò)1000名患者組織樣品的1505個(gè)CpG位點(diǎn),繪制了DNA甲基化圖譜,鑒定出24種不同腫瘤類(lèi)型的特定指紋。在此之前的大多數DNA甲基化模式研究?jì)H局限于少數患者的、屈指可數的特定基因組位點(diǎn)。

 

根據文中展望,DNA甲基化分子檢測平臺將成為癌癥臨床診斷的必要趨勢。

 

(本文轉載生物通)

 

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