腫瘤是一種病因復雜且異質(zhì)性極高的疾病,發(fā)病機制尚不完全清楚??焖侔l(fā)展的腫瘤大數據(如基因組及轉錄組數據)積累,為甄別新的腫瘤相關(guān)基因、深入理解腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機制提供了絕佳的契機。
中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所孔慶鵬課題組,通過(guò)分析來(lái)自TCGA (The Cancer Genome Atlas)數據庫的12種腫瘤的轉錄組數據發(fā)現:ERCC6L基因在12種腫瘤中都非常一致地顯著(zhù)高表達。該基因是一個(gè)新近發(fā)現的DNA解旋酶,與胚胎發(fā)育息息相關(guān),然而與腫瘤的關(guān)系卻從未見(jiàn)報道。研究人員首先通過(guò)體外細胞實(shí)驗發(fā)現,沉默ERCC6L可顯著(zhù)抑制乳腺癌細胞(MCF-7, MDA-MB-231)和腎癌細胞(786-0)的增殖,細胞周期被阻滯在G0/G1期。進(jìn)一步分析ERCC6L敲降后的細胞轉錄組數據及驗證實(shí)驗發(fā)現:ERCC6L敲降可顯著(zhù)抑制RAB31基因的轉錄和翻譯水平,同時(shí)降低RAB31下游的MAPK途徑的磷酸化水平和CDK2的蛋白表達。為了驗證體外實(shí)驗結果,課題組進(jìn)行了裸鼠成瘤實(shí)驗,結果顯示:沉默ERCC6L可于瘤細胞接種后的第七天就開(kāi)始顯著(zhù)抑制腫瘤生長(cháng)。不僅如此,ERCC6L表達水平與患者的腫瘤分期高度相關(guān),且ERCC6L高表達可預示腫瘤患者的低生存率,提示ERCC6L是腫瘤預后的良好標記物,同時(shí)也是腫瘤治療和藥物開(kāi)發(fā)的一個(gè)潛在靶點(diǎn)。該研究成果近期發(fā)表于Oncotarget雜志。課題組成員浦紹艷和博士研究生余琴為文章的共同第一作者,孔慶鵬研究員和何永捍副研究員為文章的并列通訊作者。
該項目得到了科技部973項目、國家自然科學(xué)基金及中國科學(xué)院等研究基金項目的支持。(本文轉載于生物谷)