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染色質(zhì)基因分析可識別癌癥起源 能確定白血病源頭細胞類(lèi)型

  美國杰克遜實(shí)驗室(JAX)的研究人員開(kāi)發(fā)出一種新方法,通過(guò)對開(kāi)放染色質(zhì)進(jìn)行全基因組分析,來(lái)確定導致既定類(lèi)型白血病的細胞類(lèi)型。這一方法對白血病的診療具有重要作用。

  每種癌癥都始于一個(gè)單細胞的異變。知道了癌細胞的起源細胞,研究人員就可以分析出癌癥的亞型,進(jìn)而開(kāi)發(fā)出新的診療手段,但現有方法很難從大量腫瘤細胞樣本中識別出其起源細胞。

  染色質(zhì)是細胞核內的重要成分,由DNA、組蛋白、RNA組成,在細胞進(jìn)行分裂的特定階段會(huì )聚縮成染色體。每種類(lèi)型的細胞都有一個(gè)獨特的染色質(zhì)結構,封閉染色質(zhì)會(huì )緊緊纏繞在核小體周?chē)?,相對不活躍;開(kāi)放染色質(zhì)與核小體的聯(lián)系程度則相對松散,也更活躍。杰克遜實(shí)驗室的助理教授珍妮弗·特羅布里奇博士通過(guò)分析腫瘤細胞中的開(kāi)放染色質(zhì),改進(jìn)了目前識別腫瘤細胞的起源細胞的方法。

  特羅布里奇帶領(lǐng)實(shí)驗室同事構建了一個(gè)急性髓系白血?。ˋML)的小鼠模型。他們從人類(lèi)和小鼠的骨髓中找出5種細胞:長(cháng)期造血干細胞、短期造血干細胞、多能祖細胞、普通髓系祖細胞以及粒細胞巨噬細胞祖細胞。這些不同起源細胞引發(fā)的AML在小鼠身上顯示出不同的侵入性:干細胞引發(fā)的病變更具侵入性,而祖細胞引發(fā)的病變的侵入性則要小很多。不同侵入性誘發(fā)白血病細胞出現的頻率也有所不同:干細胞高,祖細胞低。

  研究人員通過(guò)對不同AML細胞樣本的開(kāi)放染色質(zhì)進(jìn)行分析,并與正常細胞中開(kāi)放染色質(zhì)模式進(jìn)行對比,進(jìn)而確定了AML細胞樣本中開(kāi)放染色質(zhì)的特征和基因表達模式,這使他們能將干細胞引發(fā)的AML與祖細胞引發(fā)的AML區別開(kāi)來(lái)。

  研究人員表示,通過(guò)對健康人群和AML患者群的干細胞和祖細胞的開(kāi)放染色質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步研究,他們就可以基于細胞起源來(lái)確定更精確的癌癥生物標志,這對于癌癥的診斷和治療具有重要意義。

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