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Western Blot 中如何選擇內參抗體


       Western Blot 即免疫印跡試驗,可以利用 Western Blot 來(lái)比較在不同條件下,不同細胞組織中目的蛋白表達量的差異,屬于定性,半定量試驗。既然有差異性比較,參照物必不可少。Western Blot 試驗中的標準(表達量)參照物即內參,有了參照物才能準確地比較目的蛋白表達量的差異。內參一般選用管家基因表達的蛋白,它們在各個(gè)組織細胞中表達相對恒定,不會(huì )因為外部條件變化而引起表達量的變化。而且內參可以監測整個(gè)試驗體系是否正常,比如蛋白提取過(guò)程,轉膜體系,顯色體系等。

       beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 等已作為成熟的內參運用到試驗中,下面就大致介紹下如何選擇內參:

       樣本來(lái)源

       ● 如果是哺乳動(dòng)物的組織或細胞,主要以 beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 為代表;

       ● 如果是植物樣本,主要以 actin、Rubisco 為代表。

       目的蛋白定位

       ● 全細胞蛋白和細胞質(zhì):beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 等;

       ● 細胞核蛋白: PCNA 等;

       ● 核膜蛋白:Lamin B1 等;

       ● 胞膜蛋白:Na(+)/K(+) ATPase 等。

       目的蛋白分子量

       beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 的分子量分別是 42kd,50kd,37kd,目的蛋白分子量最好能與內參蛋白分子量相差 5kd 以上,才能分開(kāi)目的蛋白和內參,寫(xiě)文章做圖也更美觀(guān);

三大內參

       beta Actin,肌動(dòng)蛋白,細胞骨架蛋白。它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時(shí)常用它來(lái)做參照物。beta Actin 作為內參是得到公認的,針對大多數組織和細胞來(lái)說(shuō)的,它廣泛分布于細胞質(zhì)內,表達量非常豐富。但是在一些少量特殊的情況下比如脂肪組織和細胞內,beta Actin 的表達量就很少。

       GAPDH,甘油醛-3-磷酸脫氫酶,該酶是糖酵解反應中的一個(gè)酶,幾乎在所有組織細胞中都高水平表達,在同種細胞或組織中的表達量一般是恒定的,且很少受外部誘導物的影響。但比如缺氧和糖尿病等疾病存在下,會(huì )增加 GAPDH 在特定細胞和組織中的表達。

       beta Tubulin,微管蛋白,細胞骨架蛋白。作為內參抗體,beta Tubulin 表達通常不會(huì )發(fā)生改變,因此被廣泛用于 Western Blot 內參,也常被用于免疫染色觀(guān)察細胞的微管結構。

       下面是多年項目經(jīng)理在開(kāi)發(fā)抗體時(shí)的一點(diǎn)心得,希望對大家有幫助。

       1. 不同的內參在選擇上也要根據具體的樣本情況選擇,沒(méi)有一種內參能適用所有的組織和細胞樣本。比如,血紅細胞(因為其細胞結構的特殊性和需要攜帶氧氣的功能性)樣本就不適合以上 3 種常用內參。如果使用會(huì )導致結果很差或者沒(méi)有結果??梢赃x用血紅細胞的結構性蛋白作為內參代替。

       2. 在做多組織多細胞樣本對比表達量時(shí),最好選用 GAPDH 作為內參,因為 GAPDH 是代謝類(lèi)蛋白,在活組織中表達比較恒定。而 beta Actin 和 beta Tubulin 是結構蛋白,不同組織的細胞結構會(huì )有差異性,如腦組織的 tubulin 的表達會(huì )高一些(因為神經(jīng)細胞的軸突和樹(shù)突都由 tubulin 維持結構),而 actin 的表達量可能會(huì )低一些。再比如,骨骼肌、心肌和平滑肌的特殊功能反而導致了 tubulin 的表達改變和特化。心肌的 beta Actin 的表達量可能變少,而 alpha Actin 表達量高。因為這些組織的差異,現在慢慢采用總 Actin 和總 tubulin 作為內參,可以盡量減少一些組織表達量差異。

       3. 做各種分泌液樣本的時(shí)候,如血漿,乳汁,組織液等,以上的 3 種內參也不是很合適。由于沒(méi)有完整的細胞結構,所以只能選擇一些分泌蛋白作為內參,或者采用其他方式作為內參。

       4. 做誘導后樣本或檢測磷酸化等修飾性抗體時(shí),選擇結構蛋白作為內參,如 beta Actin 和 beta Tubulin。因為 GAPDH 是代謝類(lèi)蛋白,表達量有可能會(huì )受到誘導處理的影響。同時(shí),做修飾性抗體的 Western Blot 實(shí)驗,最好也帶上同抗原的總抗作為陽(yáng)性對照。

       5. 做 Western Blot 實(shí)驗時(shí),內參的條帶強度也要適當控制。不要讓內參條帶發(fā)生過(guò)度曝光的情況,尤其是用 X 膠片曝光的。如果內參條帶過(guò)度曝光,條帶會(huì )顯得很寬,妨礙對條帶正確強度的判讀,進(jìn)而影響對其他實(shí)驗結果的判斷。最好的內參結果是: 窄窄的,黑色實(shí)心條帶。(轉載)

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