亚洲国产一级毛片视频-无码人妻久久一区二区三区-国产一级黄色毛片视频-精品中文字幕久久久久久-亚洲精品影院综合在线观看

新浪微博
微信互動(dòng)

多重PCR反應中關(guān)鍵因素和實(shí)驗步驟

摘要: 
   多重 pcr 通過(guò)在同一個(gè)反應中同時(shí)完成多個(gè)基因的擴增成為臨床與基礎研究領(lǐng)域中一種簡(jiǎn)便快捷的篩選檢測方法。已有大量文獻詳細的討論了通常影響 PCR 反應質(zhì)量的條件,而在多重 PCR 中常見(jiàn)的困難和重要的實(shí)驗因素卻鮮見(jiàn)報道。本文使用多對引物對多重 PCR 的各種條件進(jìn)行了研究。研究表明,對于成功進(jìn)行多重 PCR 尤為重要的因素是:用于擴增不同基因的不同引物對之間的相對濃度、 PCR 緩沖液的濃度、循環(huán)溫度、氯化鎂和 dNTP 濃度間的平衡。在實(shí)驗的基礎上,本文給出了一個(gè)多重 PCR 的標準方法,并給出常見(jiàn)問(wèn)題的解決辦法。 


介紹: 

   多重 PCR 就是在同一個(gè)反應管中同時(shí)完成多個(gè)不同基因擴增的 PCR 反應。這一方法最早報道于 1988 年 ( 6 ) ,已被成功的用于缺失分析 ( 2,8 ) ,突變 ( 14 ) 與多態(tài)性 ( 11 ) ,以及定量分析 ( 10 ) 與反轉錄 PCR ( 7 ) 等多個(gè) DNA 檢測領(lǐng)域。 
   PCR 反應中各種試劑的作用已被討論過(guò) ( 3,9,12,13 ) ,也已有許多研究團體對多重 PCR 的方法進(jìn)行了描述。但是很少有人對影響多重 PCR 結果的因素(如引物濃度、循環(huán)條件等)進(jìn)行過(guò)深入的討論 ( 5,15 ) 。本實(shí)驗使用常規含 KCl 的 PCR 緩沖液對 50 種基因的各種組合進(jìn)行了多重 PCR 反應,針對伴隨多重 PCR 的一些問(wèn)題,如均一性差、某些基因難以擴出、重復性差等問(wèn)題,對影響擴增的相關(guān)參數進(jìn)行了研究?;趯?shí)驗經(jīng)驗我們設計了多重 PCR 的標準方法 (Figure 1) ,并提供了對可能碰到的許多問(wèn)題的解決方案,這對于臨床與基礎研究領(lǐng)域中使用 PCR 技術(shù)的工作者都會(huì )有所幫助。 


材料與方法: 


   PCR使用的標準溶液和試劑 


   100 mM 母液的核苷酸 (dNTP) ( 購于 Pharmacia Biotech [Piscataway, NJ, USA] 或 Boehringer Mannheim [Indianapolis, IN, USA]) (25 mM each dATP, dCTP, dGTP and dTTP). 


   標準的 10xPCR 緩沖液 (Perkin-Elmer, Norwalk, CT, USA) 包含: 500 mM KCl, 100 mM Tris-HCl, pH 8.3[at 24 ℃ ], 15 mM MgCl 2 . 


   Taq DNA 聚合酶 (Life Technologies [Gaithersburg, MD, USA]; Perkin-Elmer). 


   二甲亞砜 (DMSO), 牛血清蛋白 (BSA), 甘油 (Sigma Chemical [St. Louis, MO, USA]) 


   引物 (Genosys [The Woodlands, TX, USA]; Research Genetics [Huntsville, AL, USA])( 終濃度為 10–25 pmol/μL 。引物對 sY 用作檢測 Y 染色體上的缺失 (8,16) ;還有 10–15 對引物用于檢測 X 染色體上迪謝內肌營(yíng)養不良基因 (DMD) (4) ;其余引物用于檢測 12 號染色體上的多態(tài)性位點(diǎn),引物按 Table 1 和 Figures 2b, 3b,5e 方案組合。 


   基因組 DNA 使用標準 SDS/ 蛋白酶 K 方法制備 (Boehringer Mannheim) 


基本 PCR程序 


   PCR 反應體積為 25μL ,包括:滅菌的超純水、 PCR 緩沖液 (1x) 、 dNTP 混合物 (200μM each) 、引物 (0.04–0.6μM each); DMSO, 甘油或 BSA (5%); Taq DNA 聚合酶 (1–2 U/25μL) 和基因組 DNA 模板 (150ng/25μL) 。先加入水,其它組分可以任意順序加入,加樣在冰上進(jìn)行,加樣完成后反應管直接從冰上轉入預熱到 94 ℃的循環(huán)儀加熱模塊或水浴中。對于放射性標記的反應,在反應開(kāi)始前立即在 100μL 的反應混合液中加入 1 μCi [ 32 P] dCTP (Amersham, Arlington Heights, IL,USA) 。使用 100μL 、 25μL 、 6.2μL 反應體積得到的結果相同,對于小的反應體積,加樣(尤其是 dNTP )至關(guān)重要。實(shí)驗中使用了各種 PCR 儀,經(jīng)過(guò)細微調節后都得到了好的實(shí)驗結果。 


PCR產(chǎn)物的凝膠分析 


   在 3%SeaKem ? LE 或 NuSieve ? (3:1) 瓊脂糖凝膠 (FMC BioProducts, Rockland, ME, USA) 上對 X 、 Y 染色體上非多態(tài)性位點(diǎn)的 PCR 產(chǎn)物進(jìn)行分離,電泳緩沖液分別為 1xTAE [0.04M Tris-acetate; 0.001 M EDTA (pH8.0)] 或 1xTBE [0.09 M Tris-borate; 0.002 M EDTA (pH 8.0)] 緩沖液,電泳在室溫下進(jìn)行,電場(chǎng)強度為 7–10V/cm 。 PCR 產(chǎn)物的上樣體積相同,電泳后凝膠用 0.5–1 μ g/mL EB 染色。 


   當檢測位點(diǎn)為多態(tài)性位點(diǎn)或需要更高的分辨率時(shí)使用測序膠 (6% 聚丙烯酰胺 [PAA]/7 M 尿素 ) 。與上樣緩沖液混勻后,每泳道加入約 0.2 μ L 放射性標記的 PCR 產(chǎn)物。凝膠在 0.6xTBE 緩沖液中在 1800–2000 V (60A) 條件下電泳兩小時(shí)。過(guò)夜曝光后得到自顯影圖像。 


結果與討論 : 


   在大量實(shí)驗的基礎上,如 Figure1 所示設計出了多重 PCR 的標準方法,其中也包括了許多經(jīng)常遇到的問(wèn)題的解決方案。為了便于使用,用斜體字將步驟表與材料和方法中的各點(diǎn)及以下部分聯(lián)系起來(lái)。 


上一篇:PCR引物設計法則、特殊PCR技術(shù)、PCR產(chǎn)物電泳結果分析和經(jīng)驗總結
下一篇:熒光定量PCR實(shí)驗步驟及注意事項
分享到: