FISH(熒光原位雜交)技術(shù)我們常應用于 mRNA、miRNA 及 lncRNA 等表達及定位分析,步驟不算復雜,但想做出一張漂亮的片子也不是很容易,那么在FISH實(shí)驗中都有哪些套路?現在中洪君就和大家分享一下,希望給你帶來(lái)一些幫助!
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FISH實(shí)驗原理
熒光原位雜交(Fluorescence In Situ Hybridization,FISH)是20世紀80年代初在放射性原位雜交技術(shù)的基礎上發(fā)展起來(lái)的一種非放射性原位雜交技術(shù)。其基本原理是以熒光素標記的單鏈核酸為探針,根據堿基互補配對原則,經(jīng)過(guò)共變性—退火—復性的過(guò)程使探針與樣本DNA的互補區域雜交,與傳統的放射性標記原位雜交相比,熒光原位雜交具有快速、檢測信號強、雜交特異性高和實(shí)現多重染色等特點(diǎn)。
(熒光實(shí)拍圖,請勿盜用)
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實(shí)驗流程
FISH樣本的制備→探針的制備→探針標記→雜交→染色體顯帶→熒光顯微鏡檢測→結果分析。
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實(shí)驗步驟(甲酰胺法)
▲ 玻片準備:
將已收獲的標本滴在玻片上,在顯微 鏡下觀(guān)察滴片質(zhì)量并標記雜交區域。
理想的標本 質(zhì)量為:細胞分布均勻不重疊,密度適中,胞漿 含量少。將玻片放入已37℃水浴預溫的 2×SSC 溶液中,老化30 min。70% 、85% 、100% 的乙 醇中室溫下梯度脫水各2到3分鐘,室溫下晾干。
玻片DNA變性:
將玻片放入已在73±1℃ 水浴中預熱的70%甲酰胺/2×SSC混合液 中,每缸≤4張玻片變性3~5min,取出分別在70%、80%、100%冰乙醇缸中脫水各2分鐘而使變性終止。玻片室溫下晾干。
▲ 探針變性:
①探針準備(按產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)配制不同探針)
例:LSI BCR/ABL雙標雙融合易位探針準備如下:
a. 雜交液(buffer) 7μl
b. H2O 2μl
c. 探針 1μl
d. 加入到0.5ml離心管中混勻,離心1~3秒。
②將裝有探針的離心管放入73±1℃水浴箱中,變 性處理5分鐘,移至37℃水浴箱中預雜交5min。
▲ 雜交:將10μl探針加在玻片上已劃定的雜 交區域內,用22×22mm蓋玻片蓋好,注意 避免氣泡的出現,再用封片膠封好四周,略干后放入保濕盒內,在37℃恒溫箱中雜 交16~18h。
▲洗滌:
①將3缸50%甲酰胺/2×SSC溶液中,2缸 2×SSC置46±1℃水浴箱中預溫30 min。
②將雜交后的玻片去除蓋玻片依次放入已 46±1℃預溫的1、2、3號50%甲酰胺/2×SSC 溶液缸中,每缸≤4張玻片,洗滌各10 min。
③將玻片轉至已46±1℃預溫的2×SSC溶液 中,洗滌各5 min。
▲ 復染:每個(gè)雜交區域加DAPIⅡ10μl,蓋玻 片封片,室溫中復染15分鐘。
▲ 鏡檢:每張片隨機分析計數200~1000個(gè)間 期核,并記錄雜交信號。
▲雜交儀法
玻片準備:同甲酰胺程序的玻片處理
探針準備:同甲酰胺程序
雜交:
①將10μl探針混合液加在玻片上劃定的雜交區域 內,用22×22mm蓋玻片蓋好,封片膠封片,將 玻片放入雜交儀或恒溫熱平臺上。
②雜交儀設置:變性溫度72-75℃,時(shí)間2~5min, 雜交溫度37℃,時(shí)間16~18h
洗滌:同甲酰胺程序
復染:同甲酰胺程序
鏡檢:同甲酰胺程序
▲快速BM涂片
1)標本處理:骨髓涂片放入3:1 甲醇冰醋酸固定液中5-10 分鐘;2×SSC溶液兩缸各浸泡5分鐘 ? 70% 、85% 、100% 的乙醇中室溫下梯度 脫水各2到3分鐘,室溫下晾干 暗視野下選取雜交區域,其余步驟同雜交儀法。
(石蠟切片實(shí)拍圖)
2)石蠟切片FISH
組織切片的制備、脫蠟和水化
①制備 切片機切下厚度為4-5um組織,37℃水浴展 片,貼于玻片上,晾干,56 ℃烤過(guò)夜。
②脫蠟 用鉆石筆標出雜交區域,將切片浸入二甲 苯中,10分鐘×2次,室溫用100%的無(wú)水乙醇脫水, 5分鐘×2次
③水化 將玻片依次浸入室溫100%、85%、70% 乙醇各2分鐘水化。
3)增強組織通透性處理
①將蒸餾水和2ml EDTA加入壓力鍋燒沸
②將玻片置入沸水中,加熱至噴汽
③轉入蒸餾水中2分鐘
4)蛋白酶處理
①將蛋白酶預溫至37 ℃,切片浸入20分鐘
②轉入蒸餾水中1分鐘,再依次脫水
③室溫風(fēng)干
5)FISH雜交、洗滌、觀(guān)察同“雜交儀法”
膀胱癌脫落細胞FISH
收集晨尿,離心,收集細胞沉淀。
低滲、預固定和固定同“染色體制備”。
FISH操作步驟同“雜交儀法”。
鏡檢注意:選擇DAPI下染色不均一、核大、橢 圓的脫落細胞觀(guān)察,排除炎癥細胞。
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注意事項
FISH對檢測的條件要求很高。檢測過(guò)程中的溫度、試劑的酸堿度,反應的時(shí)間都會(huì )對結果產(chǎn)生影響。因此在操作中應注意:
1)雜交前樣本的老化相當重要,尤其是胃蛋白酶的濃度、消化的時(shí)間掌握不好,直接影響雜交的效果。若消化過(guò)度,細胞出現“鬼影”或整個(gè)組織消失成為廢片;若消化不足,則顯示持續的自發(fā)熒光或者差的DAPI染色;
2)操作過(guò)程中的溫度控制應嚴格按照產(chǎn)品說(shuō)明書(shū),而且在反應前把液體預溫到所要求的溫度,檢測中所使用的設備例如蓋玻片、載玻片都應注意預熱;
3)各步驟時(shí)間應準確,每次操作都要迅速;
4)為防止淬滅,雜交后的洗脫和晾干要注意避光??梢约尤肟勾銣鐒?;
5) 此種片在-20℃避光保存1周。若要長(cháng)期保存,應加入抗淬滅劑。