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熒光素酶報告基因實(shí)驗:研究轉錄因子和MicRNA對于靶基因調控的首先方法

       雙熒光素酶報告基因實(shí)驗(luciferase Assay)目前由兩個(gè)主要的應用方向:


       第一是檢測轉錄因子與目的基因啟動(dòng)子區DNA相互作用,轉錄因子 是一種具有特殊結構、行使調控基因表達功能的蛋白質(zhì)分子,也稱(chēng)為反式作用因子。某些轉錄因子僅與其靶啟動(dòng)子中的特異順序結合,這些特異性的序列被稱(chēng)為順式 因子,轉錄因子的DNA結合域和順式因子實(shí)現共價(jià)結合,從而對基因的表達起抑制或增強的作用。熒光素酶報告基因實(shí)驗(luciferase Assay) 是檢測這類(lèi)轉錄因子和其靶啟動(dòng)子中的特異順序結合的重要手段


       第二是研究微小RNA(microRNA)對于靶基因的調控,通過(guò)生物信息學(xué)方法預測microRNA潛在的靶基因以及干預位點(diǎn)序列,并設計合適的 microRNA質(zhì)?;蚋深A片段,同時(shí)構建靶基因的報告基因質(zhì)粒,二者同時(shí)轉染細胞,這是確定microRNA是否能影響(上調或下調)靶基因的首選研究 方法。


實(shí)驗原理:


       1)構建一個(gè)將靶啟動(dòng)子的特定片段插入到熒光素酶表達序列前方的報告基因質(zhì)粒,如pGL3-basic(轉錄因子與靶基因)或pMIR-REPORT Luciferase質(zhì)粒(微小RNA與靶基因)


       2) 將要檢測的轉錄因子表達質(zhì)粒(或microRNA質(zhì)粒)與報告基因質(zhì)粒共轉染293細胞或目的細胞。如果此轉錄因子(或microRNA)能夠激活靶啟動(dòng)子,則熒光素酶基因就會(huì )表達,熒光素酶的表達量與轉錄因子的作用強度成正比。


       3) 加入特定的熒光素酶底物,熒光素酶與底物反應,產(chǎn)生熒光素,通過(guò)檢測熒光的強度可以測定熒光素酶的活性,從而判斷轉錄因子是否能與此靶啟動(dòng)子片段有作用。


  實(shí)驗步驟:


1) 用生物信息學(xué)方法分析并預測啟動(dòng)子區可能的轉錄因子結合位點(diǎn)。


(2) 設計引物用PCR法從基因組DNA中克隆所需的靶啟動(dòng)子片段,將此片段插入到熒光素酶報告基因質(zhì)粒中。


(3) 篩選陽(yáng)性克隆,測序,擴增克隆并提純質(zhì)粒備用。


(4) 擴增轉錄因子質(zhì)粒(或microRNA質(zhì)粒),提純備用,同時(shí)準備相應的空載質(zhì)粒對照。 


(5) 培養293細胞(或其它目的細胞),并接種于6孔板中,生長(cháng)24小時(shí)(80%匯合度)。


(6) 將報告基因質(zhì)粒與轉錄因子表達質(zhì)粒共轉染細胞。


(7) 用適當的方法提取蛋白并用于熒光素酶檢測。


(8) 加入酶作用底物,于熒光計數儀上測定熒光素酶的活性。


(9) 計算相對熒光強度,并與空載對照比較,判斷影響因子是否有效的作用于靶基因。


    (本文轉載丁香通)



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