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Southern 雜交鑒定

1) 取10μl待測DNA,于一定濃度的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳。(20mL,1.0%凝膠)


2) 凝膠用溴化乙錠染色,切掉凝膠四周多余部分,并在凝膠的一角作一記號, 拍照記錄電泳結果(拍照時(shí), 凝膠旁放一尺子)。


3) 雜交用膠的制備 (做以下步驟兩組合一)


A. 將凝膠浸沒(méi)入30mL 0.25mol/L HCl溶液中15min,使DNA脫嘌呤。


B.用蒸餾水短暫洗凝膠2次。


C.將凝膠浸沒(méi)入30mL變性液中30min, 使凝膠變性。


D.將凝膠浸沒(méi)入30mL中和液中15min使它被中和。重復D一次。在制備雜交用膠時(shí)準備轉移的平臺、膜、濾紙等(4、5)。


4) 準備DNA從凝膠向膜轉移的平臺


5) 將1張待用尼龍膜和3張厚濾紙切成與待轉移膠相同大小,并在尼龍膜一角做一標記。另1張厚濾紙切成與凝膠相同寬度,長(cháng)度(約18cm)足以達到轉移液盒子的底部。準備10 X SSC 轉移液。將待用尼龍膜用蒸餾水浸濕后,再浸入10 X SSC 轉移液中。


6)安裝毛細管轉移裝置


A.將長(cháng)的濾紙放在轉移平臺的頂部,濾紙兩端達到轉移盒的底部,做成虹吸橋。


B.將8 0mL轉移液倒入轉移盒內,并濕潤濾紙。


C.將凝膠背面朝上置于濾紙搭成的橋上,凝膠與濾紙間避免有氣泡。


D.用保鮮紙封住凝膠四邊。


E.將浸濕的轉移膜置于凝膠的上部,凝膠與膜間避免有氣泡。


F.將剩下的3張濾紙小心的放在轉移膜的上面,并放一疊吸水紙搭在濾紙上,再放一玻璃板,其上壓一重物。


G.轉移幾小時(shí)或過(guò)夜(至少4小時(shí))


注意:勿使轉移液干枯。


7)已轉移的DNA與膜交聯(lián)


A.將膜放在浸有10 X SSC的厚濾紙上,有DNA的一面朝上。


B.將膜置于UV crosslinker 中,在紫外光下自動(dòng)交聯(lián)。


C.用蒸餾水短暫的漂洗已交聯(lián)的膜,空氣中干燥。此膜可在4℃長(cháng)期保存。


8)DNA探針的制備(略過(guò))參照生產(chǎn)商提供的實(shí)驗方法合成地高辛標記的探針。


9)印跡的預雜交將適量的預雜交液DIG Easy Hyb在42 ℃預熱。放入印跡膜,在42 ℃預雜交30min。


10)準備探針水煮地高辛標記的探針5min使變性, 并立即放在冰上2min。


11) 加適量的探針到已預熱的雜交液中,混合均勻(避免形成泡沫,影響雜交效果)。42 oC雜交至少4小時(shí)或過(guò)夜。


注意: 不要將探針直接加在印跡膜上,而應加在容器一角的預雜交液中。


12)印跡膜的沖洗:


A.將雜交液倒出,儲存起來(lái)可再次使用。


B. 用25mL的2 X SSC,0.1% SDS 在室溫搖動(dòng)洗膜2次,每次5min 。


C. 用已預熱的30mL 0.5XSSC,0.1%SDS 在65 oC搖動(dòng)洗膜2次,每次15min (用雜交爐)。


13)免疫檢測:


A. 用10mL沖洗液洗膜1-5min。


B. 膜在15mL阻斷液中孵育30min 。


C. 膜和8mL抗體孵育30min。


D. 在15mL沖洗液中洗膜2次,每次15min。


E. 在15mL檢測液中平衡2-5min。


14)將膜的有DNA的面朝上,放在保鮮紙上,滴數滴CSPD ready-to-use 覆蓋膜; 然后,立即用保鮮紙包裹, 擠掉多余的CSPD ready-to-use,使其均勻平鋪在膜上,沒(méi)有氣泡, 但避免使膜干掉. 室溫孵育5min。


15)在37 ℃孵育潮濕的膜10min,增強發(fā)光。


16)用X-光底片將雜交膜進(jìn)行曝光10-25min.(發(fā)光性能至少可持續48小時(shí))。


17) X-光底片的沖洗。Agfa 30顯影液顯影(1-5min)---沖水(1min)---F5定影液定影(10min)---用水沖洗---晾干底片。

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