實(shí)驗原理
一般來(lái)說(shuō)OD260代表核酸的吸光度,OD280代表蛋白質(zhì)的吸光度。OD230代表其他雜質(zhì)(多糖等)的吸光度。一般認為,OD260/OD280的比值在1.8至2.0之間認為RNA居多且較純。當比值低于1.8時(shí),考慮有蛋白質(zhì)或酚污染;當比值高于2.0時(shí),表明可能有異硫氰酸殘存。
(實(shí)拍圖)
具體操作
1、UV-1600PC紫外分光光度計開(kāi)機預熱20min;
2.設定紫外波長(cháng) 260nm,用ddH2O洗滌比色皿,向比色皿中加入 50ul ddH2O,放入樣品室的S池架上,校零;
3.將待測樣品稀釋?zhuān)≧NA 5ul用ddH2O稀釋至50μl)混勻后,記錄編號和稀釋倍數;
4.把混勻的待測樣品移入干凈的比色皿中,放進(jìn)樣品室的S架上,記錄穩定的OD260(A260)的值;
5.以同樣的方式測待測樣品在280nm下的OD值;
6.計算待測樣品的濃度與純度:
RNA樣品的濃度(ng/μl)=OD260×稀釋倍數×40;
純度=OD260/OD280
舉例說(shuō)明
某客戶(hù)某一組樣品RNA測得OD260=1.016Abs,OD280=0.533Abs
根據計算公式可得:
RNA濃度 1.016×40×10=406.4 ng/ul
RNA純度 1.016/0.533=1.906
此濃度和純度均適合做PCR。
問(wèn)題分析
(1)蛋白質(zhì)污染:確保不要吸入中間層及有機相。減少起始樣品量,確保裂解完全、徹底。加入氯仿后首先要充分混勻,并且離心分層的離心力和時(shí)間要足夠。如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,則用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。
(2)苯酚殘留:確保不要吸入中間層及有機相。加入氯仿后首先要充分混勻,并且離心分層的離心力和時(shí)間要足夠。
(3)多糖或多酚的殘留:一些特殊的組織和植物中,多糖、多酚含量較多,這些殘留也會(huì )導致OD260/OD280比值偏低。因此,從這類(lèi)材料中提取RNA時(shí),需要注意多糖、多酚雜質(zhì)的去除。
(4)設備限制:測定OD260及OD280數值時(shí),要使OD260讀數在0.1-0.5之間,此范圍線(xiàn)性最好。用水稀釋樣品:測OD值時(shí),對照及樣品稀釋液請使用10 mM Tris,pH7.5。用水作為稀釋液將導致比值偏低。