從 GenBank數據庫上搜索獲得 GeneA基因的mRNA序列。
從 網(wǎng)站 www.invitrogen.com/mai獲取工具用來(lái)設計 miRNA。
選擇 GeneA基 因 mRNA序列中21nt片段為合適miRNA靶序列。
結合線(xiàn)性化pcDNATM6.2-GW/EmGFPmiR真核表達載體(Invitrogen公司)的特點(diǎn),設計4個(gè)64nt的pre-miRNA寡核苷酸序列,該序列針對 GeneA基因不同區域,并且得到寡核苷酸序列互補的序列,經(jīng)NCBI Blast的相似性搜索,排除其非特異同源性部分。
其結構為 5’-TGC TG overhang + G + antisense target sequence+ miRNA loop + Sense target sequence-3’。
將4對合成好的oligo進(jìn)行退火。
將退火的4條雙鏈oligo用T4DNA連接酶與酶切后的線(xiàn)性載體連接。
取連接反應物轉化 DH5α菌株,挑選陽(yáng)性克隆質(zhì)粒,PCR鑒定與培養。
利用小量提取試劑盒小提質(zhì)粒,經(jīng) PCR擴增后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,取陽(yáng)性克隆菌液送公司測序鑒定。